Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB4P16144 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms