Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UCHL3P15374 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UCHL3P15374 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms