Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms