Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARBP10826 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARBP10826 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARBP10826 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARBP10826 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARBP10826 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARBP10826 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARBP10826 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARBP10826 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms