Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV1-8P0DP01 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms