Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC192P0DO97 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC192P0DO97 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms