Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4AP0C0L4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms