Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB4AP04350 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms