Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms