Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms