Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms