Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR5O75473 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR5O75473 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR5O75473 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR5O75473 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR5O75473 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR5O75473 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LGR5O75473 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR5O75473 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR5O75473 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR5O75473 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR5O75473 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR5O75473 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR5O75473 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR5O75473 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR5O75473 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR5O75473 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR5O75473 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR5O75473 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms