Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms