Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms