Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNMO15061 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNMO15061 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNMO15061 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNMO15061 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNMO15061 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNMO15061 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNMO15061 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNMO15061 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNMO15061 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNMO15061 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNMO15061 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNMO15061 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNMO15061 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNMO15061 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNMO15061 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNMO15061 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms