Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4O00268 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4O00268 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4O00268 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4O00268 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4O00268 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4O00268 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4O00268 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4O00268 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4O00268 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4O00268 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4O00268 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4O00268 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4O00268 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4O00268 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms