Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KTA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KTA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KTA2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KTA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KTA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KTA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KTA2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KTA2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KTA2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KTA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KTA2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms