Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO7DNF2Z398 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms