Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms