Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC10BA6NIK2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms