Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NDN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NDN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NDN8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NDN8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NDN8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NDN8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NDN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NDN8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NDN8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NDN8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A6NDN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms