Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWB2

TRBV7-9, T-cell receptor beta variable 7-9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV7-9A0A0J9YWB2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms