Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms