Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK8P49336 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK8P49336 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK8P49336 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK8P49336 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK8P49336 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK8P49336 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms