Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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