Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 FMR1-220ENST00000621987 1352 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 LYPD5-201ENST00000377950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AC010326.4-202ENST00000603829 541 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LMO3Q8TAP4 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC016831.5-201ENST00000605249 1998 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 NKIRAS2-205ENST00000393881 1598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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