Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC4Q9Y696 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms