Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms