Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIT1Q9Y3P8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms