Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms