Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC5A6Q9Y289 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC5A6Q9Y289 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms