Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POMPQ9Y244 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms