Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS5Q9UPZ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms