Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms