Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APEX2Q9UBZ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms