Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXL2Q9NZ53 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXL2Q9NZ53 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms