Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA3Q9NZ52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms