Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAH9Q9NYC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms