Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms