Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms