Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER2Q9NSB8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOMER2Q9NSB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOMER2Q9NSB8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms