Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRC4Q9NPP4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRC4Q9NPP4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC4Q9NPP4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms