Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDFQ9HBH1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDFQ9HBH1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDFQ9HBH1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms