Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A1Q9BZW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A1Q9BZW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms