Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRXQ9BXM0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRXQ9BXM0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRXQ9BXM0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRXQ9BXM0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms