Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms