Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERPUD2Q9BSE4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HERPUD2Q9BSE4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms