Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC50A1Q9BRV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms