Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL4Q9BPW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL4Q9BPW4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms