Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl22Q99JN2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl22Q99JN2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl22Q99JN2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl22Q99JN2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl22Q99JN2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl22Q99JN2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl22Q99JN2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms